Efter tilslutningen til Landbrug & Fødevarer består Mejeriforeningen af to afdelinger, hhv. Økonomi og Skolemælk. Endvidere er to medarbejdere tilknyttet Morgenmælkskampagnen.
17 medarbejdere varetager opgaver omkring administration, økonomi og skolemælk.
Løsningen af de faglige opgaver er overført til Landbrug & Fødevarer.
Bestyrelsen er Mejeriforeningens overordnede ledelse og består af 6 medlemmer.
Direktionen er Mejeriforeningens daglige, overordnede ledelse.
Ledelsessekretariatet er en sekretariatfunktion for den øverste ledelse i Mejeriforeningen.
Økonomi består af to afdelinger, som arbejder med Mejeriforeningens interne driftsforhold opdelt på områderne økonomi og IT- og Ejendomsservice.
Området omfatter det overordnede ansvar for de markedsvendte aktiviteter samt udvikling af mælkens sundhedsposition.
Mejeriernes Skolemælksordning administrerer skolemælksordningen for 1.400 skoler i Danmark. Vi distribuerer mælken til skolerne som neutral udbyder for mejeribranchen.
Mejeriforeningen gennemfører i 2009-11 en kampagne med støtte fra EU.
Mejeriforeningen har en række udvalg, der håndterer forskellige sagsområder og særlige problemstillinger.
Mejeriforeningen er knyttet til fonde på flere forskellige måder.
Dansk mejeribrug rummer en lang række selvstændige foreninger, der er ejet af mejerier, virksomheder med tilknytning til mejeribruget og af andre organisationer. Nogle af disse foreninger er knyttet til Mejeriforeningen i kraft af, at de har sekretariat i Mejeriforeningen.
Mejeriforeningen ejer 50 pct. af aktierne selskabet Agri-Norcold A/S, der driver køle- og frysehuse.